染色體核型分析是對(duì)整個(gè)基因組進(jìn)行分析，包括染色體數(shù)目異常和結(jié)構(gòu)異常，在血液腫瘤的診斷、疾病危險(xiǎn)度評(píng)估、預(yù)后分層、治療方案選擇和治療效果監(jiān)測(cè)、靶向治療以及是否需要進(jìn)行骨髓移植的選擇等方面有重要臨床意義。● 骨髓/外周血/腦脊液/胸腹水/淋巴組織(G顯帶)染色體核型分析[CA]
CLL首選標(biāo)本為外周血，需用兩種不同的方法進(jìn)行培養(yǎng)和分析，收取兩份費(fèi)用
● 先天性染色體異常核型分析[CB]
標(biāo)本必須用外周血；診斷體質(zhì)性染色體改變，或遺傳性/先天性疾病的染色體異常。
● 染色體斷裂試驗(yàn)[CC]
標(biāo)本必須用外周血；用于范可尼貧血（先天性再障）的診斷和鑒別診斷。
熒光原位雜交(FISH)項(xiàng)目
FISH是從細(xì)胞水平檢測(cè)基因的異常，包括基因的丟失、擴(kuò)增/增加、易位等，或細(xì)微的染色體結(jié)構(gòu)異常，染色體數(shù)目異常，以及識(shí)別mar染色體（染色體水平無(wú)法識(shí)別其結(jié)構(gòu)異常的染色體）。可檢測(cè)間期細(xì)胞，不受中期分裂象限制，也可檢測(cè)中期分裂象，尤其在檢測(cè)與預(yù)后密切相關(guān)且有眾多伙伴基因的基因方面具有明顯優(yōu)勢(shì)。
● 雙色探針[C1]
● 單色探針
● 骨髓涂片/病理石蠟包埋切片F(xiàn)ISH[C1A]
每一張涂片多做兩種不同的FISH探針檢測(cè)，按探針數(shù)收費(fèi)。
● 間期細(xì)胞性別染色體FISH(X/Y)[C2A]
常用于供受者性別不同的移植時(shí)，移植后供受者細(xì)胞比例的動(dòng)態(tài)監(jiān)測(cè)。
● 染色體全長(zhǎng)探針（涂抹探針）FISH[C2C]
用于識(shí)別mar染色體或隱匿性易位
FISH多探針組合
● AML 4探針組合[C4A]
RUNX1-RUNX1T1；CBFB分離探針；PML-RARA；MLL分離探針
● AML 8探針組合[C4B]
RUNX1-RUNX1T1；CBFB分離探針；MLL分離探針；PML-RARA；GATA2,MECOM；TP53；DEK-NUP214；MLLT3-MLL
● MDS 5探針組合[C5A]
EGR1/D5S23；D7S486/CEP7；CEP8；D20S108；TP53
● MDS 8探針組合[C5B]
EGR1/D5S23；D7S486/CEP7；CEP8；D20S108；MLL；CEPY；GATA2,MECOM；TP53
● B-ALL 4探針組合[C6A]
BCR-ABL1；E2A分離探針；iAMP21；MLL分離探針
● B-ALL 10探針組合[C6B]
BCR-ABL1；CHIC2/D10Z1/D17Z1；E2A分離探針；ETV6-AML1；iAMP21；
IGH分離探針；MLL分離探針；MYC分離探針；NUP214-ABL1；P16/D9Z3
● B-ALL高危及靶向治療相關(guān)11探針組合[C6C]
BCR-ABL1；CRLF2；P2RY8；PDGFRB；E2A分離探針；ETV6-AML1；
iAMP21；MLL分離探針；NUP214-ABL1；JAK2分離探針；TP53
● BCR-ABL1樣5探針組合ALL[C7]
BCR-ABL1；IGH@-CRLF2；P2RY8-CRLF2；PDGFRB分離探針；JAK2分離探針
● T-ALL 4探針組合[C8]
NUP214-ABL1；TRA-D/C分離探針；TCF3分離探針；PDGFRB分離探針
● CLL 4探針組合[C9A]
ATM/CEP11；CEP12；D13S319；TP53
● CLL 8 探針組合 [C9B]
ATM/CEP11；CCND1-IGH；CEP12；D13S319；IGH-BCL2；IGH分離探針；MYB；TP53
● 多發(fā)性骨髓瘤(MM)5探針組合[C10]
CCND1-IGH；FGFR3-IGH；IGH-MAF；TP53；1q21擴(kuò)增
● 淋巴瘤4探針組合[C11A]
IGH-BCL2；CCND1-IGH；IGH 分離探針；MYC 分離探針。組織印片/ 新鮮標(biāo)本，不包括病理切片。
● DLBCL 4探針組合[C11B]
IGH-BCL2；BCL6分離探針；CCND1-IGH；MYC/CEP8-IGH三色探針。組織印片/新鮮標(biāo)本，不包括病理切片。
● MCL4探針組合[C11C]
CCND1-IGH；CEP12；D13S319；TP53。組織印片/ 新鮮標(biāo)本，不包括病理切片
● 神經(jīng)母細(xì)胞瘤2探針組合[C12]
MYCN；1p36微缺失
● 嗜酸相關(guān)基因3探針組合[C13]
FGFR1；PDGFRA；PDGFRB；
[可另行加做JAK2分離探針（2016版WHO:PCM1-JAK2融合基因也與嗜酸異常相關(guān)）]
● 自選4探針
FISH檢測(cè)相關(guān)基因臨床意義簡(jiǎn)介
● RUNX1-RUNX1T1，t(8;21)(q22;q22)
見(jiàn)于約8%成人和12%兒童AML，不伴KIT突變者預(yù)后好，伴KIT、FLT3突變者用TKIs有效。
● CBFB分離探針，inv(16)(p13q22)
inv(16)(p13q22)形成CBFB-MYH11融合基因，通常見(jiàn)于伴嗜酸性粒細(xì)胞增高的AML，不伴KIT突變者預(yù)后好。
●PML-RARA，t(15;17)(q24;q21)
見(jiàn)于98%的AML-M3，是APL的主要診斷指標(biāo)。
●DEK-NUP214，t(6;9)(p23;q34)
見(jiàn)于約1-2%的AML，通常預(yù)后較差。
●MLLT3-MLL，t(9;11)(p22;q23)
見(jiàn)于AML，尤其是在M5中多見(jiàn)，在所有累及MLL的異常中，預(yù)后相對(duì)較好，在AML中預(yù)后中等。
● MLL(KMT2A) 分離探針，t(v;11q23)/del(11q)
MLL基因易位見(jiàn)于各類型白血病，包括AML、ALL、MAL、t-AML等，總發(fā)生率約10%，在嬰兒B-ALL中發(fā)生率達(dá)85%，AML中常見(jiàn)于M4和M5，初發(fā)AML占3%、治療相關(guān)AML占10%，預(yù)后差。
目前已報(bào)道的MLL伙伴基因有近百種，PCR方法難以檢測(cè)少見(jiàn)的融合類型，而MLL分離探針可檢測(cè)各種MLL易位。
●D7S486/CEP7，-7/del(7q31)
-7/del(7q)發(fā)生于約15%的成人MDS，40%的兒童MDS，50%的治療相關(guān)
AML/MDS，在MDS中del(7q)預(yù)后中等；-7預(yù)后差。AML中-7預(yù)后差。
● EGR1/D5S23，-5/del(5q31)
常見(jiàn)于MDS、AML，在MDS中發(fā)生率占10-15%。MDS中del(5q)預(yù)后好，而在AML中-5/del(5q)預(yù)后差。
●CEP8，+8
常見(jiàn)于AML、MDS和CML急變時(shí)，AML/MDS中單獨(dú)+8時(shí)預(yù)后中等，CML患者病程中在t(9;22)易位的基礎(chǔ)上出現(xiàn)+8，往往提示疾病進(jìn)入加速期或急變期，是疾病進(jìn)展的高危因素。
●D20S108，20q12/del(20q12)
常見(jiàn)于MDS、MPN、AML等，在MDS患者中預(yù)后好，MPD中預(yù)后不受影響。
●GATA2,MECOM，inv(3)(q21.3q26.2)/t(3;3)(q21.3;q26.2)
主要見(jiàn)于AML、MDS，發(fā)生率約2-5%，預(yù)后極差。
●BCR-ABL1，t(9;22)(q34;q11)
見(jiàn)于CML、ALL、AML等，BCR-ABL1易位是CML的特征性異常，伴BCR-ABL1的急性白血病多預(yù)后差。伴BCR-ABL1易位者對(duì)TKIs治療有效。
●ETV6(TEL)-AML1，t(12;21)(p13;q22)
主要見(jiàn)于兒童B-ALL，發(fā)生率約25%，預(yù)后好。細(xì)胞遺傳學(xué)水平不易檢出此異常，需用FISH或PCR方法檢測(cè)。
●E2A分離探針，t(1;19)(q23;p13.3)/ t(17;19)(q22;p13.3)
主要見(jiàn)于B-ALL，t(1;19)是E2A常見(jiàn)的重排，出現(xiàn)在5%的B-ALL和20%的前B-ALL中，易侵犯中樞神經(jīng)系統(tǒng)，早期強(qiáng)化療能顯著改善療效；t(17;19)在所有ALL中占1%，預(yù)后差。
● iAMP21擴(kuò)增
見(jiàn)于2%的B-ALL，是復(fù)發(fā)的高風(fēng)險(xiǎn)指標(biāo)，常規(guī)治療效果差，早期發(fā)現(xiàn)，大劑量高強(qiáng)度化療能顯著改善療效。FISH是有效的檢測(cè)方法。
● CHIC2/D10Z1/D17Z1，+4/+10/+17
檢測(cè)B-ALL超二倍體染色體，在高超二倍體B-ALL中，當(dāng)+4/+10/+17同時(shí)出現(xiàn)時(shí)，預(yù)后特別好。
● IGH分離探針，t(v;14q32)
見(jiàn)于B細(xì)胞腫瘤，包括B-ALL和B細(xì)胞淋巴瘤。IGH有多個(gè)易位伙伴基因，
IGH分離探針可檢測(cè)各種IGH易位。
●P16(CDKN2A)-D9Z3，9p21/del(9p21)
約10%兒童ALL可檢出del(9p21)，尤其在T-ALL中發(fā)生率高，伴del(9p21)者中約90%可檢測(cè)到P16基因丟失。
● MYC分離探針，t(v;8q24)
可檢測(cè)各種MYC基因的易位。BL中85%為t(8;14)(q24;q32)，10%為t(2;8)
(p11;q24)，5%為t(8;22)(q24;q11)；t(8;14)(q24;q32)還可見(jiàn)于DLBCL(5%-22%)、FL、DHL/THL；MYC異常在DLBCL、DHL/THL、FL中預(yù)后差。約2%的T-ALL中可見(jiàn)t(8;14)(q24;q11.2),對(duì)治療反應(yīng)差。
● MYC/CEP8-IGH三色探針
檢測(cè)t(8;14)(q24;q32)染色體易位及8號(hào)染色體數(shù)目異常。
● NUP214-ABL1
主要見(jiàn)于約6%的T-ALL，TKIs治療有效。
●TRA/D 14q11.2
約30%的兒童T-ALL中常常累及T細(xì)胞受體基因TCRA\TCRB\TCRG\TCRD的易位，TRA/D探針可檢測(cè)包括t(10;14)(q24;q11.2)、t(1;14)(p32;q11.2)t(11;14)
(p15;q11.2)、t(11;14)(p13;q11.2)等涉及14q11位點(diǎn)的各種TCRA/D易位。
● TLX3分離探針5q35
由于t(5;14)(q35;q32)易位而致TLX3表達(dá)失調(diào)，見(jiàn)于20%的兒童T-ALL和13%的成人T-ALL，t(5;14)(q35;q32)易位通常是隱匿性的，細(xì)胞遺傳學(xué)方法難以識(shí)別，用FISH方法可有效檢測(cè)。預(yù)后差。
● ATM/CEP11，CEP11/del(11q22)
ATM位于11q22，缺失常在CLL中出現(xiàn)，ATM缺失提示預(yù)后差，同時(shí)伴TP53突變時(shí)，預(yù)后更差。
● CEP12，12號(hào)著絲粒/12三體
12號(hào)染色體三體在CLL中多見(jiàn)，預(yù)后中等或差；在MCL中預(yù)后差。
●D13S319，13q14/del(13q14)
13q14缺失見(jiàn)于很多惡性血液腫瘤，包括CLL、MM、MCL、DLBCL等，在CLL中發(fā)生率約55%，預(yù)后好，在MM中發(fā)生率約16-40%，預(yù)后中等或差。
●CCND1-IGH，t(11;14)(q13;q32)
是MCL的標(biāo)志性異常；MM中也常見(jiàn)，在MM中預(yù)后較好或中等。
●IGH-BCL2，t(14;18)(q32;q21)
見(jiàn)于FL、DLBCL等淋巴系統(tǒng)腫瘤；若同時(shí)有IGH-BCL2和MYC基因易位的Double-Hit或Triple-Hit淋巴瘤預(yù)后差。
●D6Z1-MYB，6q23/del(6q23)
CLL中約5%患者可見(jiàn)，預(yù)后不良。
● BCL6分離探針3q27
涉及BCL6基因(3q27)的易位，見(jiàn)于30%-35%的DLBCL和10-15%的FL淋巴瘤，在DLBCL中預(yù)后差。
● CEPX/CEPY，X/Y著絲粒
異性別造血干細(xì)胞移植后嵌合狀態(tài)檢測(cè)，實(shí)時(shí)，準(zhǔn)確性高。
●TP53，del(17)(p13)
TP53是重要的抑癌基因，幾乎見(jiàn)于各種髓、淋系腫瘤，其丟失或突變?cè)诟鞣N血液腫瘤中都是預(yù)后差的標(biāo)志。
● MM常見(jiàn)相關(guān)基因的FISH檢測(cè)
◇CCND1-IGH，t(11;14)(q13;q32)
是MCL的標(biāo)志性異常；MM中也常見(jiàn)，在MM中預(yù)后較好或中等。
◇ FGFR3-IGH，t(4;14)(p16;q32)
是MM特征性異常，預(yù)后差。至少85%的t(4;14)患者同時(shí)存在del(13q)。
◇ IGH-MAF，t(14;16)(q32;q23)
見(jiàn)于約5%的MM患者，易位后可導(dǎo)致MAF基因過(guò)表達(dá)，預(yù)后差。
◇1q21擴(kuò)增/1p32丟失
是MM中常見(jiàn)異常之一，發(fā)生率約30-35%，與疾病的進(jìn)展密切相關(guān)，伴此異常患者生存期短，預(yù)后差。硼替佐米等新藥治療不能克服其不良預(yù)后。
◇TP53，del(17)(p13)
在MM患者中約占10%。它的缺失導(dǎo)致患者對(duì)化療藥物不敏感，預(yù)后極差。
● 與嗜酸粒細(xì)胞增高相關(guān)基因的FISH檢測(cè)
◇ FGFR1 8p11
與FGFR1相關(guān)疾病中，常表現(xiàn)為淋巴瘤，特別是T-LBL伴嗜酸粒細(xì)胞增多，
CEL或AML。已鑒定出于FGFR1形成融合蛋白的伙伴基因有14種。
◇ PDGFRA 4q12
與PDGFRA相關(guān)疾病中，常表現(xiàn)為CEL伴有顯著肥大細(xì)胞系累及，或AML伴嗜酸粒細(xì)胞增多。常由于4q12隱匿性缺失形成FIPIL1-PDGFRA融合基因。
◇ PDGFRB分離探針
可檢測(cè)各種PDGFRB基因易位。PDGFRB融合基因見(jiàn)于MPN、MDS、AML、B-ALL、T-ALL等各種類型白血病，也是BCR-ABL1樣ALL中較常見(jiàn)的異常，通常TKIs治療有效。目前已報(bào)道的PDGFRB伙伴基因超過(guò)20種，常見(jiàn)的是ETV6(TEL)-PDGFRB。約8%Ph-like ALL存在EBF1-PDGFRB
融合基因。
◇PCM1-JAK2t(8;9)(p22;p24.1)
2016版WHO提出將髓系/淋系腫瘤伴t(8;9)(p22;p24.1)/PCM1-JAK2作為一個(gè)暫定的新的分類亞型。PCM1-JAK2融合基因陽(yáng)性患者常呈現(xiàn)慢性髓系腫瘤特點(diǎn)，例如MPN或MDS/MPN，50%-70%有嗜酸性粒細(xì)胞增高和/或骨髓纖維化；較少伴發(fā)T-LBL或B-ALL；骨髓形態(tài)紅系增生明顯伴淋巴細(xì)胞聚集。JAK抑制劑治療效果欠佳，預(yù)后差，早期需考慮異基因造血干細(xì)胞移植。可用JAK2斷裂分離探針推測(cè)PCM1-JAK2融合基因的存在。
● BCR-ABL1樣B-ALL相關(guān)基因的FISH檢測(cè)
◇ ABL1基因
目前已報(bào)道ABL1除BCR外還有至少7個(gè)其它伙伴基因，次常見(jiàn)的為TEL-ABL1，而且大多用伊馬替尼等激酶抑制劑(TKIs)治療有效。用BCR-ABL1融合基因探針間接檢測(cè)任何涉及ABL1的易位。
◇ CRLF2分離探針
約50%BCR-ABL1樣B-ALL中存在CRLF2易位，常見(jiàn)CRLF2-IGH，CRLF2易位或突變的ALL多伴有JAK1/2或ABL1家族的激酶活化突變，JAK抑制劑治療有效。
◇ P2RY8丟失探針
P2RY8與CRLF2基因均位于Xp22或Yp11上，相距大約300kb，其間的擬常染色質(zhì)區(qū)微缺失致P2RY8基因增強(qiáng)子與CRLF2基因啟動(dòng)子并置，導(dǎo)致CRLF2基因過(guò)表達(dá)。JAK抑制劑治療有效。
◇ PDGFRB分離探針
可檢測(cè)各種PDGFRB基因易位。PDGFRB融合基因見(jiàn)于MPN、MDS、AML、B-ALL、T-ALL等各種類型白血病，也是BCR-ABL1樣ALL中較常見(jiàn)的異常，通常TKIs治療有效。目前已報(bào)道的PDGFRB伙伴基因超過(guò)20種，常見(jiàn)的是ETV6(TEL)-PDGFRB。約8%Ph-likeALL存在EBF1-PDGFRB融合基因。
◇ JAK2分離探針
JAK2基因位于9q24，是細(xì)胞因子信號(hào)通路上的一種酪氨酸激酶，在MPN、BCR-ABL1樣ALL中都可見(jiàn)JAK2的突變和易位，常見(jiàn)的易位伙伴基因有：PCM1、BCR、ETV6、SSBP2和3q21；在BCR-ABL1樣ALL中已報(bào)導(dǎo)的易位伙伴基因有ATF7IP、BCR、EBF1、ETV6、PAX5、PPFIBP1、SSBP2、STRN3、TERF2、TPR，采用JAK2分離探針，均可有效檢測(cè)JAK2基因是否受累，無(wú)需考慮其伙伴基因。是JAK2抑制劑治療靶點(diǎn)。
● 神經(jīng)母細(xì)胞瘤相關(guān)基因的FISH檢測(cè)
◇ MYCN，MYCN擴(kuò)增
神經(jīng)母細(xì)胞瘤特有的遺傳學(xué)改變，預(yù)后差。
◇ 1p36微缺失
1p36微缺失導(dǎo)致腫瘤抑制基因失活，多見(jiàn)于神經(jīng)母細(xì)胞瘤，預(yù)后不良。
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